你好，假设在北京延庆区，想了解预付工资扣3%的手续费合法吗？

具体操作：
1. 协商阶段：明确扣费原因，要求公司提供扣费依据，如合同、规章制度等。若公司无法提供合法依据，可要求退还手续费。
2. 投诉举报阶段：收集相关证据，如工资条、扣费记录等，向延庆区劳动监察大队提交投诉材料。劳动监察部门将进行调查处理。
3. 诉讼阶段：若投诉举报未能解决问题，可聘请律师，准备相关证据材料，向人民法院提起诉讼。法院将依法审理案件，作出判决。在诉讼过程中，应积极配合法院调查，提供必要证据。
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处理方式：
从法律角度看，处理此类问题的方式主要有协商、投诉举报和诉讼三种。
选择建议：首先尝试与公司协商，了解扣费原因及依据；若协商无果，可向当地劳动监察部门投诉举报；必要时，可通过法律途径提起诉讼，维护自身权益。
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预付工资扣3%手续费需具体分析，可能不合法。
分析：根据《劳动法》及相关规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠。预付工资时扣除手续费，若未经双方明确约定且无法律依据，则可能构成对劳动者工资的非法克扣。
提醒：若公司长期、普遍地扣除预付工资手续费，且无法提供合法依据，表明问题严重，应及时咨询律师并采取法律措施。